無理に横長にしなくてもレイアウトを工夫すれば普通に入ると思いますよ。
画像はエルカミツ2体験版の画面をそのまま640x360(コンソール80x45)に入れた例。(プチコンではなく画像編集して作りました)
コマンド選択画面とか入れ忘れましたが、それを含めても画面に収まると思います。
Switchは横長といっても16:9なので3DSの上画面(5:3)と大して変わらないですよ。
あとプチコン4だとアンチエイリアスがかかるので、3号でSPSCALEした時のように文字がつぶれたりもしないはずです。
(そもそもスイッチの画面は1280x720なので640x360でつくるときれいに表示できます)
まあでも、これだとLOCATEやDISPLAYの置き換えではなく、画面表示をプチコン4で作り直す必要がありますね。