自分が気になったのは
1. ゲートタイム指定コマンドQが3号では8までだったのが32まで指定でき8のままだとぶつ切りの音になる
2. 3号では@144〜151の番号にあったPSG、ノイズ音源が@216〜223になっている
3. @128のドラムなどでもシンバル等の音長が調整できるようになっている。これによって3号では32分音符でシンバルが長く鳴らせたのができなくなっている
あと、音色の質や音量が変わっているので3号から4へ移植する際は単純に上記の3点を修正するだけでは不十分な感じです。
他にはキー変更や歌唱機能のコマンド、ドラム音源が追加されているので公式リファレンスが参考になると思います
https://sup4.smilebasic.com/doku.php?id=reference:top